2000年4月6日“南昌航院大学生心理健康教育与咨询中心”正式挂牌，是学工处下设机构，2006年4月咨询中心整体搬迁到前湖校区大学生活动中心，共有九间用房，设有学生接待室、个体心理咨询室、音乐治疗室、团体心理辅导室、办公室等，共约300余平方米使用面积。咨询中心配备有专职教师五名，兼职教师多名。中心还配备了计算机、打印机、传真机、电视机、数码相机、扫描仪、音乐治疗仪、多种测试量表及统计软件，图书，杂志等较为齐全的设备，提高了大学生心理健康教育与咨询工作的规范化和科学化。
本中心致力于为全校大学生提供心理健康教育与咨询服务。开展大学生心理健康教育工作的目的在于助人自助，我们本着一份爱心无条件接纳来访的你，与你一同去面对人生，为你在学习、生活、工作、情感、人际交往、择业中出现的困扰与不适，提供认真、全面、综合的辅导，协助你完善自我，共创健康人生。
近年来，我校在开展大学生心理健康教育与咨询工作中取得了一定的成绩，在江西省高校中形成了独有的特色，且多次在省教育厅专家检查中得到高度评价，2019年获得“全省大学生心理健康教育与咨询示范中心建设学校、“江西省高校大学生心理健康教育工作先进个人”荣誉称号、“江西省高校心理健康教育教师职业能力大赛”一等奖、“全国高校心理委员研究协作组理事”单位、“全国百佳心理委员”等荣誉。